1、TAE与TBE各自分散范畴

TAE缓冲液保举用于剖析分子量大于1500 bp DNA片断和超螺旋DNA条带；TBE缓冲液保举用于剖析分子量小于1500 bp DNA片断和变性聚丙烯酰胺凝胶电泳。大片断DNA分子在TBE缓冲液中不克不及完全分散。 

2、电泳凝胶

准确的凝胶浓度对DNA Marker的优化分散十分紧张。DNA Marker中分子量偏小的较准确分散型DNA Marker（比方DL1003等）一样平常选择高浓度凝胶，好比琼脂糖凝胶浓度选择在1.5%-3%之间；而较大分子量的DNA Marker（比方DL10004等），琼脂糖凝胶浓度一样平常选择在0.7%-1.5%。

制备凝胶的缓冲液要和电泳缓冲液坚持分歧，别的肯定要在凝胶完全凝结后再拔去梳子。

3、电泳条件

电泳时，电压发起为5-8 V/cm。电压过低会招致条带弥散。电压过高会使凝胶过热和DNA变性，还大概呈现条带弯曲等带型。

电泳缓冲液不宜太陈腐，应该活期改换；电泳时，凝胶只管即便放电泳槽两头，在电泳槽双方大概招致条带倾斜。

4、DNA Marker安排条件

DNA Marker较频仍利用的可以室温或4℃安排，不然可以-20℃保管。

5、DNA条带呈现弥散，弯曲等不规矩带型 

DNA Marker条带呈现弥散大概涂抹，大概缘故原由有DNA降解，电泳工夫过长、电压过低、过量染色和脱色、紫外照相工夫过长。

DNA 条带呈现弯曲、月牙外形以及锯齿状等不规矩带型，大概为电压过高，上样量太多、凝胶没有消融好、凝胶没有完全凝结、胶孔质量差、身分中含有杂质如卵白质、样品中盐浓度与缓冲液盐浓度存在较大差别等等。

6、电泳时Marker前端条带容易变弱或是丧失 

常用染料如溴化乙啶（EB）等带正电荷，而核酸带负电荷，电泳历程中溴化乙啶（EB）迁徙偏向与核酸相反而且两者联合不是非常结实，招致凝胶前端联合核酸的溴化乙啶（EB）零落并向凝胶后端迁徙，从而前端条带显得较弱或是丧失。一样平常电泳时溴酚蓝迁徙到凝胶长度2/3及可中止。

7、凝胶浓度影响电泳分散结果

条带少数由小于1500 bp DNA片断构成的DNA Marker一样平常选择高浓度凝胶，琼脂糖凝胶浓度发起在1.5%-3%，而条带少数由大于1500 bp DNA片断构成的DNA Marker一样平常选择低浓度凝胶，琼脂糖凝胶浓度发起在0.7%-1.5%。

            图1                               图2           

在以上两幅图中，图1和图2为异样的一种DNA Marker（条带少数由小于1500 bp DNA片断构成）在相反电泳条件和电泳工夫，差别凝胶浓度的电泳后果。

图1琼脂糖凝胶浓度为0.8%，图2琼脂糖凝胶浓度为2%。后果表现出在浓度为0.8%的凝胶中很难到达较好的分散结果。

8、电泳呈现样品滞留在点样孔

DNA联合卵白（如毗连酶、磷酸酶、限定酶等）改动DNA的凝胶迁徙率，大概招致DNA停顿在点样孔处；上样量过多、DNA降解或是胶孔质量较差等也都有大概呈现滞留在点样孔征象。

9、样品条带与DNA Marker条带相比，呈现比实践巨细偏大征象

DNA的迁徙不但仅与实在际巨细有干系，与能否联合有卵白、离子形态、DNA的布局、凝胶布局等都有关。在电泳时，单个样品条带的巨细与DNA Marker相比，会呈现偏大几十bp之多。

10、盐浓度对电泳影响

电泳时的盐浓度影响DNA的带型。配胶的缓冲液和电泳缓冲液最好为同时设置装备摆设，电泳槽中缓冲液要实时改换，样品及Marker中的上样Buffer要只管即便坚持分歧。电泳呈现不规矩条带，大概必要思索盐浓度题目。假如是样品中盐分过多，有须要进一步的纯化。