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中国迷信家开辟替换Cas9的基因编辑新技能
2016-5-6
泉源:生物探究
点击数: 10903          作者:未知
  •        RNA导向的核酸内切酶Cas9使得基因编辑成为了一种普遍使用的技能。但是,只管迷信家们已实验多种方法对Cas9体系举行优化以进步它的服从和特异性,但该体系的适用性仍然遭到了一些要素的限定,包罗其对导向-靶向(guide–target)错配的耐受性以及导向RNA绝对容易构成二级布局等。

          相似于Cas9,来自Argonaute卵白家属的内切酶也可以使用寡核苷酸作为引导,降解侵入性的基因组。Argonautes在基因表达克制以及抵抗外来核酸方面起着要害的作用。4月12日,宣布在《PNAS》上的一项研讨中,加州大学伯克利分校的研讨职员展现了一种Argonaute非典范的导向RNA特异性,论文的通讯作者是CRISPR先驱之一的Jennifer A. Doudna。

           5月2日,最新宣布在《Nature Biotechnology》上的一项研讨中,河北科技大学以及浙江大学医学院的研讨职员陈诉称,Natronobacterium gregoryi Argonaute(NgAgo)是一种DNA导向的可用于人类细胞基因编辑的核酸内切酶。NgAgo可联合约24个核苷酸巨细的5′磷酸化单链导向DNA(guide DNA,gDNA),无效构成位点特异的DNA双链缺口。

          据悉,CRISPR/Cas9的靶向特异性是由两局部决议的,一局部是RNA嵌合体和靶DNA之间的碱基配对,另一局部是Cas9卵白和一个短DNA基序(DNA motif)的联合,这个短DNA基序通常在靶DNA的3'末了发明,被称为前间区序列临近基序(protospacer adjacent motif,PAM)。

          与Cas9差别,NgAgo–gDNA体系不必要PAM,开端判定标明,该体系对导向-靶向(guide–target)错配耐受低,且对编辑富含G+C的基因组愈加无效。据介绍,Cas9只存在于原核生物中,而Argonautes简直存在于一切的无机体中。

          别的,要想与Cas9准确绑定,导向RNA必需有3′RNA-RNA杂化布局,而与Argonaute绑定不必要导向分子有任何特定的二级布局。另一方面,Cas9只能切割PAM下游的序列,而Argonaute不必要靶标有特定的序列。作者们表现,Natronobacterium gregoryi Argonaute无望成为编辑哺乳植物基因组的精准无效的东西。

    参考文献:DNA-guided genome editing using the Natronobacterium gregoryi Argonaute. doi:10.1038/nbt.3547

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